يتكون فحص الاعتداء الجنسي من جزأين: جمع الأدلة الجنائية لاستخدامها في التحقيق في الدعوى الجنائية، والرعاية الطبية لتقييم وعلاج الإصابات.
خلال الجزء الطبي من الفحص، تُحدد الإصابات أو الحالات الطبية الأخرى وتُعالج. نتائج الفحوصات الطبية ستكون متاحة من المنشأة الطبية التي تُجرى فيها الفحوصات.
خلال الجزء الجنائي من الفحص، تُجمع الأدلة. قد تُستخدم الأدلة في التحقيق.
اعتمادًا على طبيعة الاعتداء، قد يتم جمع العناصر التالية أثناء الفحص:
تمشيط الشعر،
مسحات من مناطق في الجسم قد تحتوي على ترسبات للحمض النووي،
مسحات من مناطق تلامس الأعضاء التناسلية،
مسحات/قصاصات الأظافر،
العناصر المتبقية، و
الملابس.
قد تُلتقط صور لإصابات سطح الجسم أو إصابات الأعضاء التناسلية أثناء الفحص.